Esteban Hoijman estudió Biología en la Universidad de Buenos Aires, donde también obtuvo su título de doctor. Tras una estancia en el Hubrecht Institute de Holanda, fue investigador postdoctoral en la Universidad Pompeu Fabra y en el Centro de Regulación Genómica de Barcelona.
Estableció su grupo de investigación independiente en el Instituto de Investigación Biomédica de Bellvitge, gracias a una posición Serra Húnter de la Universidad de Barcelona. Recientemente, se incorporó de forma permanente al Instituto de Biología Molecular de Barcelona (CSIC).
Su grupo estudia el mundo de las células dentro de embriones vivos en las primeras etapas del desarrollo. Filmar estas células les permite explorar su comportamiento y entender cómo se mueven, se comunican y se organizan para formar órganos, repararlos o responder a infecciones.
Esteban ha realizado importantes contribuciones al campo, siendo autor principal de publicaciones en revistas como Nature y Cell Host & Microbe. Además, es un firme defensor de la divulgación científica y participa activamente en acercar la ciencia a la sociedad.